Stacija ierīkota dzelzceļa būves laikā 1860. gadā. Tās nosaukums mainīts vairākas reizes: "Rušani" – 1919. gads, "Rušūna" – 1921. gads, "Rušona" – 1925. gads, līdz 1934. gadā tā pārdēvēta par Aglonu. Lai arī apmūrēta, stacijas ēka saglabājusies no pašiem dzelzceļa pirmsākumiem.